磷鎢酸常用作普通的病毒、多糖、神經(jīng)和其他生物學(xué)組織的負(fù)染色，利用透射電子顯微鏡進(jìn)行進(jìn)一步觀察。還有關(guān)于PTA應(yīng)用于多種尼龍、聚合體等不易被其他電子著色劑進(jìn)行著色的物質(zhì)。使用PTA最主要的優(yōu)勢是PH值能夠調(diào)整到希望的大小。有些程序還將PTA用作定色劑。 

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